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2025年4月，廈門大學附屬第一醫院等機構的研究人員在BMC Cancer上發表文章《Unravelling NK cell subset dynamics and specific gene signatures post-ibrutinib therapy in chronic lymphocytic leukaemia via single-cell transcriptomics》，解析伊布替尼治療后慢性淋巴細胞白血病患者NK細胞亞群的動態演變及其關鍵基因特征，為優化免疫治療策略提供依據。
研究人員對慢性淋巴細胞白血病（Chronic Lymphocytic Leukemia，CLL）患者的外周血樣本（包括初診、伊布替尼治療后完全緩解/部分緩解及Richter綜合征患者）進行了單細胞轉錄組測序，結合t-SNE/UMAP聚類分析及軌跡分析，發現NK細胞可劃分為CD56bright_NK、CD56dim_NK及CLL_NK三種亞群，其中CLL_NK亞群在治療后顯著增加且高表達細胞毒性基因，并通過軌跡分析證實其為其他亞群的分化前體。
隨后，研究人員進一步通過Mendelian隨機化和共定位分析篩選出12個與CLL進展相關的關鍵基因，構建了CLL_NK細胞指數（CNI），發現高CNI與患者腫瘤微環境中免疫細胞浸潤水平正相關，并且利用OncoPredict預測及分子對接驗證高CNI患者對伊布替尼、氟達拉濱等藥物敏感性更強。上述結果表明，CLL_NK亞群的動態演變及其基因特征可為解析伊布替尼治療機制及優化個體化治療策略提供關鍵依據。
研究中單細胞轉錄組測序作為關鍵技術為后續復雜分析奠定了基礎，單細胞轉錄組文庫構建過程中采用了貝克曼庫爾特生命科學SPRIselect核酸片段篩選試劑盒進行cDNA片段和index PCR產物的純化和雙側片段篩選，去除非目標產物、確保文庫片段長度符合測序要求。
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參考文獻：
Liu C, Ding T, Zou R, Zhang A, Zhi Z, Wang S. Unravelling NK cell subset dynamics and specific gene signatures post-ibrutinib therapy in chronic lymphocytic leukaemia via single-cell transcriptomics. BMC Cancer. 2025 Apr 21;25(1):745. doi: 10.1186/s12885-025-14166-0.
